Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED29Q9NX70 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED29Q9NX70 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms