Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HPF1Q9NWY4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HPF1Q9NWY4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPF1Q9NWY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPF1Q9NWY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms