Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2orf42Q9NWW7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C2orf42Q9NWW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf42Q9NWW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf42Q9NWW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms