Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLN6Q9NWW5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLN6Q9NWW5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLN6Q9NWW5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN6Q9NWW5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms