Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCP11L1Q9NUJ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCP11L1Q9NUJ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCP11L1Q9NUJ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TCP11L1Q9NUJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TCP11L1Q9NUJ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms