Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATG3Q9NT62 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATG3Q9NT62 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATG3Q9NT62 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATG3Q9NT62 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATG3Q9NT62 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms