Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLCO1B3Q9NPD5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B3Q9NPD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1B3Q9NPD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms