Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARD6AQ9NPB6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6AQ9NPB6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6AQ9NPB6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARD6AQ9NPB6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6AQ9NPB6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms