Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDFQ9HBH1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDFQ9HBH1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDFQ9HBH1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDFQ9HBH1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDFQ9HBH1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms