Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMOC1Q9H4F8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMOC1Q9H4F8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMOC1Q9H4F8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMOC1Q9H4F8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMOC1Q9H4F8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms