Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTIF3Q9H2K0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTIF3Q9H2K0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTIF3Q9H2K0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTIF3Q9H2K0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTIF3Q9H2K0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTIF3Q9H2K0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms