Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A4Q9H015 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC22A4Q9H015 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A4Q9H015 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms