Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD1Q9GZZ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD1Q9GZZ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD1Q9GZZ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms