Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDEL1Q9GZM8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDEL1Q9GZM8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDEL1Q9GZM8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDEL1Q9GZM8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms