Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCSER1Q9C0I3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCSER1Q9C0I3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCSER1Q9C0I3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCSER1Q9C0I3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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