Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL4Q9C0H6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL4Q9C0H6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL4Q9C0H6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL4Q9C0H6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms