Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM9Q9C026 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM9Q9C026 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM9Q9C026 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM9Q9C026 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM9Q9C026 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms