Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TINF2Q9BSI4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TINF2Q9BSI4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TINF2Q9BSI4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TINF2Q9BSI4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TINF2Q9BSI4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TINF2Q9BSI4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TINF2Q9BSI4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms