Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH4

TACO1, Translational activator of cytochrome c oxidase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACO1Q9BSH4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TACO1Q9BSH4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TACO1Q9BSH4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TACO1Q9BSH4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TACO1Q9BSH4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TACO1Q9BSH4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TACO1Q9BSH4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TACO1Q9BSH4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms