Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERPUD2Q9BSE4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERPUD2Q9BSE4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERPUD2Q9BSE4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms