Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D3AQ9BRG2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SH2D3AQ9BRG2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH2D3AQ9BRG2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2D3AQ9BRG2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms