Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3CQ99985 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3CQ99985 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3CQ99985 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms