Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BARD1Q99728 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BARD1Q99728 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARD1Q99728 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARD1Q99728 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms