Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SDF2Q99470 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDF2Q99470 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDF2Q99470 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDF2Q99470 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms