Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNC2Q96PR1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNC2Q96PR1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNC2Q96PR1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms