Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GBP4Q96PP9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GBP4Q96PP9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GBP4Q96PP9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GBP4Q96PP9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms