Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MRPL53Q96EL3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL53Q96EL3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MRPL53Q96EL3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms