Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM44Q96DX7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM44Q96DX7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM44Q96DX7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM44Q96DX7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms