Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMCO6Q96DC7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO6Q96DC7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO6Q96DC7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO6Q96DC7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms