Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
OPTNQ96CV9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
OPTNQ96CV9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
OPTNQ96CV9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OPTNQ96CV9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
OPTNQ96CV9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms