Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC45Q96CN5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRC45Q96CN5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRC45Q96CN5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC45Q96CN5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRC45Q96CN5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC45Q96CN5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC45Q96CN5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms