Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ROPN1LQ96C74 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ROPN1LQ96C74 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROPN1LQ96C74 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms