Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF21AQ96BD5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PHF21AQ96BD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHF21AQ96BD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF21AQ96BD5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms