Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCEAL3Q969E4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCEAL3Q969E4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCEAL3Q969E4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCEAL3Q969E4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms