Protein–RNA interactions for Protein: Q92615

LARP4B, La-related protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4BQ92615 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LARP4BQ92615 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LARP4BQ92615 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP4BQ92615 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LARP4BQ92615 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP4BQ92615 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP4BQ92615 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LARP4BQ92615 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LARP4BQ92615 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP4BQ92615 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LARP4BQ92615 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP4BQ92615 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP4BQ92615 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LARP4BQ92615 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LARP4BQ92615 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP4BQ92615 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LARP4BQ92615 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP4BQ92615 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LARP4BQ92615 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LARP4BQ92615 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP4BQ92615 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP4BQ92615 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP4BQ92615 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP4BQ92615 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LARP4BQ92615 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP4BQ92615 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP4BQ92615 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP4BQ92615 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LARP4BQ92615 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP4BQ92615 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP4BQ92615 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LARP4BQ92615 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LARP4BQ92615 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LARP4BQ92615 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LARP4BQ92615 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LARP4BQ92615 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms