Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNOT9Q92600 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT9Q92600 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNOT9Q92600 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms