Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC4Q8WW27 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC4Q8WW27 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC4Q8WW27 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOBEC4Q8WW27 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms