Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
U2AF1L4Q8WU68 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L4Q8WU68 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L4Q8WU68 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
U2AF1L4Q8WU68 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
U2AF1L4Q8WU68 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms