Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COG1Q8WTW3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COG1Q8WTW3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms