Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLGN4YQ8NFZ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLGN4YQ8NFZ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLGN4YQ8NFZ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLGN4YQ8NFZ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms