Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRFBP1Q8NEF9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRFBP1Q8NEF9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRFBP1Q8NEF9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRFBP1Q8NEF9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms