Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHE23Q8NDY6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BHLHE23Q8NDY6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BHLHE23Q8NDY6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms