Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPC24Q8NBT2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPC24Q8NBT2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPC24Q8NBT2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms