Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC63Q8NA47 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC63Q8NA47 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC63Q8NA47 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC63Q8NA47 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms