Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA1Q8N8W4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNPLA1Q8N8W4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNPLA1Q8N8W4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms