Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDUFAF2Q8N183 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NDUFAF2Q8N183 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDUFAF2Q8N183 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NDUFAF2Q8N183 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms