Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HACE1Q8IYU2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HACE1Q8IYU2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HACE1Q8IYU2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.9 ms