Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf40Q8IXQ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf40Q8IXQ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf40Q8IXQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf40Q8IXQ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms