Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MCF2L2Q86YR7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCF2L2Q86YR7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCF2L2Q86YR7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCF2L2Q86YR7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms