Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SMG6Q86US8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMG6Q86US8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMG6Q86US8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMG6Q86US8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMG6Q86US8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SMG6Q86US8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMG6Q86US8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMG6Q86US8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMG6Q86US8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SMG6Q86US8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMG6Q86US8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SMG6Q86US8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMG6Q86US8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMG6Q86US8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMG6Q86US8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMG6Q86US8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SMG6Q86US8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SMG6Q86US8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMG6Q86US8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMG6Q86US8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SMG6Q86US8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SMG6Q86US8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SMG6Q86US8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SMG6Q86US8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SMG6Q86US8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SMG6Q86US8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SMG6Q86US8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SMG6Q86US8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMG6Q86US8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMG6Q86US8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms